Mikroskobu ilk icat eden kişi, Hollandalı bilim insanı Zacharias Janssen‘dir. 1590’larda, Janssen ve babası Hans Janssen, ilk basit mikroskobu geliştirdiler. Ancak, mikroskobun daha da geliştirilmesine önemli katkılar sağlayan ve modern mikroskopların temellerini atan kişi Anton van Leeuwenhoek olmuştur. Leeuwenhoek, 17. yüzyılın ortalarında mikroskopları geliştirerek mikroskobik dünyayı keşfetmiş ve mikroorganizmaları ilk defa gözlemlemiştir.