Kolonya Cumhuriyeti filminin çekimleri, İstanbul’un farklı platolarında ve Kocaeli’ndeki doğal alanlarda yapılmıştır. Özellikle büyük kalabalık sahneler için stüdyo ortamı hazırlanmış, cumhuriyet meydanı sahneleri de özel olarak inşa edilen setlerde çekilmiştir.

Filmde geçen “Kolonya” adlı hayali kasaba tamamen dekor olarak kurulmuştur. Yani gerçek bir kasaba ya da şehirde değil, prodüksiyon ekibi tarafından oluşturulan yapay bir set içinde çekilmiştir.