Mavi su, genellikle insan sağlığı için zararlı olan bir madde değildir. Ancak, mavi suyun rengini veren kimyasal maddeler veya boyalar, içerdikleri bileşenlere bağlı olarak zararlı olabilir. Örneğin, bazı mavi boya türleri kurşun veya civa gibi toksik maddeler içerebilir ve bu maddelerin teması veya solunumu sağlık sorunlarına neden olabilir.

Ayrıca, mavi suyun bulunduğu suyun kimyasal bileşimi veya pH seviyesi de önemlidir. Örneğin, aşırı klor içeren mavi su, cilt tahrişine veya gözlerde yanmaya neden olabilir. Ayrıca, yüksek pH seviyeleri içeren mavi su, deri kuruluğuna veya tahrişine yol açabilir.

Son olarak, bazı insanlar için mavi suyun kokusu veya tadı rahatsız edici olabilir ve bu da mavi suyun kullanımını zorlaştırabilir. Ancak, genel olarak, mavi suyun kullanılmasının sağlık üzerinde doğrudan zararlı etkileri olduğu pek yaygın değildir.