Tohumun çimlenmesi, bitkilerin büyümeye başlamadan önce geçirdiği önemli bir aşamadır ve aşağıdaki adımlarla gerçekleşir:

1. Su Emme (Hidrasyon): Tohum, çevresindeki suyu emmeye başlar. Bu su, tohumun kabuğunu yumuşatır ve içindeki metabolik reaksiyonları başlatır.

2. Yeniden Aktivasyon: Su emildikçe tohumun içinde bulunan enzimler aktive olur ve besin maddeleri (starch, protein vb.) çözülmeye başlar. Bu da büyüme için gerekli enerjiyi sağlar.

3. Çimlenme Başlangıcı: Tohumun dış kısmı şişer ve çatlar. Tohumun embriyosu (fide) bu noktada büyümeye başlar. Genellikle önce embriyonun kök kısmı (radikal) çıkar.

4. Kök Gelişimi: İlk çıkan kök, toprağa yerleşir ve tohumun besin maddelerini alabilmesi için kök sistemi gelişir. Bu kök, su ve besinleri toprağa bağlı olarak alır.

5. İlk Yaprakların Gelişimi: Kök, besin maddelerini aldıktan sonra tohumun gövdesi büyür ve ilk yapraklar (kotiledonlar) çıkmaya başlar. Bu aşama bitkinin güneş ışığına ihtiyacı olduğu fotosentez için gereklidir.

6. Fotosentez Başlangıcı: İlk yapraklar güneş ışığını almaya başladığında fotosentez başlar ve bitki kendi besinini üretir.

Bu aşamalar, tohumun uygun koşullar altında (su, sıcaklık, oksijen ve ışık gibi faktörler) çimlenme sürecine girmesini sağlar.